Российская атомная подводная лодка специального назначения таинственно исчезает при выполнении секретного задания в водах Гренландского моря. На её поиски направляется группа под командованием Виктора Воронина, чей старший брат был капитаном пропавшего судна. Перед командой стоит сложнейшая задача — во что бы то ни стало обнаружить субмарину и не допустить, чтобы новейшее секретное вооружение оказалось в руках противника.
Тем временем в результате геологических изысканий на полярной станции пробуждается Кракен — гигантское морское чудовище, способное растворяться в подводном мраке и обладающее невероятным интеллектом. Именно эта древняя тварь становится главной угрозой для моряков, отважившихся спуститься в глубины в поисках пропавшей подлодки.